注文の「個数制限」は設定できますか？

はい。1回の注文あたりの最大購入数を商品ごとに設定可能です。[管理画面]>[商品]>[商品を選択して編集ページ]>[詳細設定]>[一度に注文できる個数の制限]より、設定が可能です。